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Altersuhren

CausAge (kausalitätsbewusste Altersuhr)

ENCausAge (causality-aware clock)

Geprüft von

CausAge ist eine von de Lima Camillo und Kollegen (Preprint 2022; Nature Aging 2024) eingeführte epigenetische Altersuhr, die eine grundlegende Schwäche korrelationstrainierter Uhren zu überwinden versucht: Standardmäßige Elastic-Net- oder Regressionsuhren wählen CpG-Stellen aus, die mit dem Alter assoziiert sind, ohne zu unterscheiden, ob die Methylierungsänderung den Alterungsprozess verursacht, von ihm herrührt oder lediglich mit ihm kovariiert. CausAge nutzt Mendelian-Randomisierungs-gestützte Kausalinferenz, um CpGs zu identifizieren, deren Methylierungsveränderung dem biologischen Altern eher vorausgeht, und leitet daraus die Sub-Uhren DamAge (schadensassoziierte Altersbeschleunigung) und AdaptAge (adaptive Antwort) ab. Das Framework legt nahe, dass Uhr-CpGs in ihrer kausalen Rolle heterogen sind und mortalitätsassoziierte Altersbeschleunigung primär von schadensbezogenen und nicht von adaptiven CpG-Sites getrieben wird.

Quellen

  1. Ying K, Liu H, Tarkhov AE, Sadler MC, Lu AT, Moqri M, Horvath S, Kutalik Z, Shen X, Gladyshev VN. (2024). Causality-enriched epigenetic age uncouples damage and adaptation. *Nature Aging*doi:10.1038/s43587-023-00557-0