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Altersuhren

PCPhenoAge

Geprüft von

PCPhenoAge ist eine technisch verfeinerte Variante der DNAm PhenoAge-Uhr, die Higgins-Chen und Kollegen 2022 vorstellten. Sie wendet eine Hauptkomponentenregression (PC) auf die zugrunde liegenden CpG-Daten an, bevor der Alterswert berechnet wird. Diese Transformation beseitigt technisches Rauschen und Batch-Effekte, die die Varianz bei Standard-Methylierungsarrays aufblähen, und liefert eine Uhr mit deutlich besserer Test-Retest-Zuverlässigkeit und geringerer Anfälligkeit gegenüber Probenqualität oder Preprocessing-Pipeline. In der Praxis behält PCPhenoAge die mortalitätsprädiktorische Validität ihrer Vorgängerin, ist aber für Längsschnittstudien und Interventionsstudien besser geeignet, in denen intraindividuelle Veränderungen der primäre Endpunkt sind.

Quellen

  1. Higgins-Chen AT, Thrush KL, Wang Y, Minteer CJ, Kuo PL, Wang M, Niimi P, Sturm G, Lin J, Moore AZ, Bandinelli S, Vinkers CH, Vermetten E, Rutten BPF, Geuze E, Okhuijsen-Pfeifer C, van der Horst MZ, Schreiter S, Gutwinski S, Luykx JJ, Picard M, Ferrucci L, Poganik JR, Bhanu NV, Garcia BA, Horvath S, Raj K, Levine ME. (2022). Epigenetic principal component analysis-based clocks (PC clocks) accurate across tissues. *Nature Aging*doi:10.1038/s43587-022-00248-2